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SIMULACIÓN DE SISTEMAS POLIMÉRICOS COMPLEJOS Y PROTEINAS


   
 Centro: F. CIENCIAS QUIMICAS  Acceso a su web
 Director/es:REY GAYO, ANTONIO
 Miembros:FREIRE GOMEZ, JUAN JOSE; PEREZZAN RODRIGUEZ, RAMIRO GABRIEL; PRIETO FRIAS, LIDIA; RUBIO CAPARROS, ANA MARIA ;
 Descripción:

En nuestro trabajo de investigación, proponemos el uso de técnicas de simulación molecular en ordenador y modelos con diferentes grados de resolución para la investigación de sistemas macromoleculares complejos.

Los aplicamos, como objetivo más activo en este momento, al problema del plegamiento y agregación de proteínas. En esta línea nuestro grupo ha sido pionero en España, y propone unas herramientas de modelización molecular que pueden complementar, de forma ventajosa en muchas ocasiones, a los programas más habituales con resolución atómica que constituyen hoy en día el grueso de los paquetes informáticos comerciales. Nuestra aproximación utiliza modelos reducidos, en un abordaje multidisciplinar de nuestros objetivos de investigación que utiliza herramientas de la física, la química y la biología para lograr una comprensión lo más profunda posible de los sistemas abordados.

Además, en colaboración con miembros externos del grupo en la UNED (el grupo del Prof. Juan J. Freire), simulamos polímeros sintéticos, concretamente nanopartículas de dendrímero y problemas de compatibilidad de mezclas poliméricas. Estos sistemas tienen relevancia tecnológica en diferentes áreas, desde vectores para el transporte de fármacos a procesos industriales. Aunque por problemas personales recientes de algunos de los integrantes del grupo de investigación estos sistemas han ocupado un papel secundario en nuestro trabajo de los últimos años, planeamos darles un nuevo impulso dada su importancia, y la posibilidad de ampliar el campo de aplicación de nuestra metodología.

 Líneas de investigación: Propiedades conformacionales de macromoléculas; Simulación en ordenador de sistemas complejos; Propiedades de transporte y dinámicas de polímeros en disolución; Procesos de autoorganización en sistemas macromoleculares; Estudio por simulación del plegamiento de proteínas; Análisis de potenciales de campo medio; Optimización mediante algoritmos evolutivos; Competencia entre agregación y plegamiento en proteínas
 Palabras clave: Plegamiento de proteínas; Simulación en ordenador; Análisis conformacional; arquitectura macromolecular; compatibilidad de polímeros; agregación; polímeros en forma de anillo; dendrímeros; simulación molecular; polímeros complejos
 Acceso a su web: Acceder